De cross-compliance voorwaarden in het kader van het hervormde Europese landbouwbeleid MTR zorgen voor hoofdbrekens bij menig Vlaamse landbouwer.
In totaal lopen 576 Vlaamse landbouwers een boetepercentage op bij de uitbetaling van hun bedrijfstoeslag 2005. Dit boetepercentage varieert van 1 tot 5 procent korting op het totale bedrag. Daarnaast lopen nog eens 513 landbouwers gelijkaardige kortingen op bij hun gekoppeld gebleven rundveepremies, zijnde de zoogkoeienpremie en de slachtpremie voor kalveren. In totaal wordt één derde van de Vlaamse gecontroleerde landbouwers gekort in hun EU-inkomenstoeslagen.
Meest niet-nageleefde beheersnorm in 2005 was het niet-instandhouden van het areaal permanent grasland, maar hiervoor werden (voorlopig) nog geen sanctioneringen doorgevoerd.